Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SKIP12755 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIP12755 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIP12755 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIP12755 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIP12755 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIP12755 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIP12755 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIP12755 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIP12755 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIP12755 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIP12755 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIP12755 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIP12755 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIP12755 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIP12755 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIP12755 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIP12755 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIP12755 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIP12755 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIP12755 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIP12755 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIP12755 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIP12755 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIP12755 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIP12755 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIP12755 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIP12755 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIP12755 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIP12755 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIP12755 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIP12755 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIP12755 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKIP12755 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIP12755 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIP12755 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIP12755 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIP12755 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIP12755 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIP12755 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIP12755 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIP12755 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIP12755 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKIP12755 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIP12755 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIP12755 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIP12755 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIP12755 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIP12755 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIP12755 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIP12755 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIP12755 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKIP12755 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIP12755 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIP12755 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIP12755 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIP12755 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIP12755 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIP12755 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKIP12755 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIP12755 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIP12755 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIP12755 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIP12755 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIP12755 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIP12755 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIP12755 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIP12755 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIP12755 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIP12755 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SKIP12755 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKIP12755 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKIP12755 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKIP12755 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKIP12755 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKIP12755 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKIP12755 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKIP12755 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIP12755 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIP12755 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIP12755 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIP12755 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIP12755 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIP12755 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIP12755 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIP12755 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIP12755 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIP12755 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIP12755 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIP12755 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIP12755 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIP12755 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIP12755 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKIP12755 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIP12755 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIP12755 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIP12755 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIP12755 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIP12755 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKIP12755 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms