Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB2P05107 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB2P05107 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB2P05107 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB2P05107 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGB2P05107 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB2P05107 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB2P05107 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB2P05107 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB2P05107 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB2P05107 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB2P05107 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB2P05107 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB2P05107 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB2P05107 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB2P05107 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGB2P05107 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB2P05107 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB2P05107 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB2P05107 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB2P05107 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB2P05107 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB2P05107 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB2P05107 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB2P05107 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB2P05107 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB2P05107 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB2P05107 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGB2P05107 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB2P05107 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB2P05107 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB2P05107 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB2P05107 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB2P05107 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB2P05107 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB2P05107 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms