Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-AP01891 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-AP01891 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HLA-AP01891 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-AP01891 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-AP01891 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-AP01891 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-AP01891 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-AP01891 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms