Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MARCH6O60337 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms