Protein–RNA interactions for Protein: O15439

ABCC4, Multidrug resistance-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC4O15439 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC4O15439 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC4O15439 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC4O15439 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC4O15439 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC4O15439 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC4O15439 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC4O15439 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC4O15439 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC4O15439 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC4O15439 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC4O15439 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC4O15439 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC4O15439 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC4O15439 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC4O15439 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC4O15439 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms