Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRTO14522 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
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