Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR6O00574 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR6O00574 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR6O00574 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR6O00574 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR6O00574 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR6O00574 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CXCR6O00574 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR6O00574 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR6O00574 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR6O00574 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR6O00574 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR6O00574 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR6O00574 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR6O00574 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR6O00574 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR6O00574 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR6O00574 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR6O00574 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR6O00574 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR6O00574 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR6O00574 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR6O00574 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR6O00574 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCR6O00574 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms