Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP99D6REC4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms