Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF233A6NK53 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF233A6NK53 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF233A6NK53 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF233A6NK53 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF233A6NK53 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF233A6NK53 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF233A6NK53 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF233A6NK53 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms