Protein–RNA interactions for Protein: A1A4G5

LNP1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1A1A4G5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LNP1A1A4G5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNP1A1A4G5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms