Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms