Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms