Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms