Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms