Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRN4Q8WUT4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms