Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA3Q8TBC4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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