Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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