Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms