Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms