Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPTBN1Q01082 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms