Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP46P62068 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP46P62068 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP46P62068 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP46P62068 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP46P62068 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
USP46P62068 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP46P62068 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP46P62068 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP46P62068 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP46P62068 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP46P62068 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP46P62068 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP46P62068 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP46P62068 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP46P62068 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP46P62068 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP46P62068 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP46P62068 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP46P62068 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP46P62068 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP46P62068 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP46P62068 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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