Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms