Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms