Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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