Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms