Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CENPFP49454 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CENPFP49454 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CENPFP49454 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CENPFP49454 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CENPFP49454 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CENPFP49454 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPFP49454 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPFP49454 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CENPFP49454 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CENPFP49454 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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CENPFP49454 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPFP49454 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CENPFP49454 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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