Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELFEP18615 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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NELFEP18615 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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NELFEP18615 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NELFEP18615 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELFEP18615 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NELFEP18615 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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NELFEP18615 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NELFEP18615 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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