Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms