Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BPIFA1Q9NP55 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BPIFA1Q9NP55 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BPIFA1Q9NP55 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BPIFA1Q9NP55 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BPIFA1Q9NP55 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BPIFA1Q9NP55 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BPIFA1Q9NP55 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BPIFA1Q9NP55 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BPIFA1Q9NP55 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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BPIFA1Q9NP55 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BPIFA1Q9NP55 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BPIFA1Q9NP55 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BPIFA1Q9NP55 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BPIFA1Q9NP55 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BPIFA1Q9NP55 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BPIFA1Q9NP55 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BPIFA1Q9NP55 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BPIFA1Q9NP55 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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