Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms