Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms