Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AL512274.1-201ENST00000562471 2027 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms