Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms