Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms