Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP13Q92995 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms