Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NEDD1Q8NHV4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms