Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
WDR53Q7Z5U6 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
WDR53Q7Z5U6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms