Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 OR52P2P-201ENST00000527287 955 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 ADIPOR1P2-201ENST00000554199 820 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 CLPP-204ENST00000596149 745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AL031773.1-201ENST00000453579 554 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AC011389.2-201ENST00000514811 365 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 TUBAP-201ENST00000425085 1352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 KIR2DL1-201ENST00000291633 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AC015802.4-203ENST00000592622 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 FAM230A-201ENST00000615181 315 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 CLUHP3-207ENST00000563678 1303 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 SRSF10-205ENST00000374452 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP350Q5VT06 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms