Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ZNF239Q16600 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ZNF239Q16600 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ZNF239Q16600 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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