Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SYCP1Q15431 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SYCP1Q15431 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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