Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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NCAPHQ15003 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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