Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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