Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms