Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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