Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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FOXE3Q13461 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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FOXE3Q13461 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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FOXE3Q13461 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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