Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms