Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNA1Q09470 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms