Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ME1P48163 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ME1P48163 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ME1P48163 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ME1P48163 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ME1P48163 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms