Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP13P45452 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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