Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TSPOP30536 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TSPOP30536 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TSPOP30536 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms